Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne5Q8JZW4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms