Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasgef1bQ8JZL7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasgef1bQ8JZL7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasgef1bQ8JZL7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rasgef1bQ8JZL7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rasgef1bQ8JZL7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rasgef1bQ8JZL7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rasgef1bQ8JZL7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rasgef1bQ8JZL7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms