Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf628Q8CJ78 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf628Q8CJ78 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms