Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Celf3Q8CIN6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Celf3Q8CIN6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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