Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc178Q8CDV0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms