Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc73Q8CDM4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc73Q8CDM4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms