Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CrebrfQ8CDG5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CrebrfQ8CDG5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrebrfQ8CDG5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms