Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
6030452D12RikQ8CD33 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms