Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms