Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms