Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nhsl1Q8CAF4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nhsl1Q8CAF4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nhsl1Q8CAF4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms