Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm9958Q8C9U4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm9958Q8C9U4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm9958Q8C9U4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm9958Q8C9U4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm9958Q8C9U4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm9958Q8C9U4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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