Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp20Q8C6M1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp20Q8C6M1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp20Q8C6M1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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