Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhe22Q8C6A8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms