Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930504O13RikQ8C5Z9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930504O13RikQ8C5Z9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
4930504O13RikQ8C5Z9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930504O13RikQ8C5Z9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms