Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930572O03RikQ8C5Y0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
4930572O03RikQ8C5Y0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms