Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3M9

Uncharacterized protein C2orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3M9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C3M9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C3M9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q8C3M9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8C3M9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8C3M9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms