Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh12Q8BYK4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms