Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TnrQ8BYI9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TnrQ8BYI9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TnrQ8BYI9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms