Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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Trerf1Q8BXJ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trerf1Q8BXJ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Trerf1Q8BXJ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Trerf1Q8BXJ2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Trerf1Q8BXJ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Trerf1Q8BXJ2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Trerf1Q8BXJ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Trerf1Q8BXJ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trerf1Q8BXJ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Trerf1Q8BXJ2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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