Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Skor1Q8BX46 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Skor1Q8BX46 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms