Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall4Q8BX22 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms