Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmod1Q8BVA4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmod1Q8BVA4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms