Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hirip3Q8BLH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hirip3Q8BLH7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms