Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp54Q8BL06 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms