Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan12Q8BKT6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan12Q8BKT6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tspan12Q8BKT6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tspan12Q8BKT6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms