Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d3Q8BJ83 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d3Q8BJ83 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms