Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo28Q8BIG4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo28Q8BIG4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo28Q8BIG4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms