Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdca8Q8BHX3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdca8Q8BHX3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms