Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Vipas39Q8BGQ1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vipas39Q8BGQ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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Vipas39Q8BGQ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Vipas39Q8BGQ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vipas39Q8BGQ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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