Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubash3bQ8BGG7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubash3bQ8BGG7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms