Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pknox2Q8BG99 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Pknox2Q8BG99 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Pknox2Q8BG99 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pknox2Q8BG99 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pknox2Q8BG99 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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