Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Necab1Q8BG18 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Necab1Q8BG18 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms