Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NfascQ810U3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NfascQ810U3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms