Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ChfrQ810L3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms