Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc28Q80XJ3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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