Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lca5Q80ST9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lca5Q80ST9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lca5Q80ST9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms