Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube2q1Q7TSS2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ube2q1Q7TSS2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2q1Q7TSS2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2q1Q7TSS2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2q1Q7TSS2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2q1Q7TSS2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube2q1Q7TSS2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms