Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf516Q7TSH3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf516Q7TSH3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms