Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dsg1bQ7TSF1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms