Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSA6

Proser3, Proline and serine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proser3Q7TSA6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Proser3Q7TSA6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms