Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS5

B630019K06Rik, RIKEN cDNA B630019K06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B630019K06RikQ7TNS5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
B630019K06RikQ7TNS5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
B630019K06RikQ7TNS5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms