Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Uhrf2Q7TMI3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Uhrf2Q7TMI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms