Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tigd3Q7TM95 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tigd3Q7TM95 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms