Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdcl2Q78Y63 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms