Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme8Q715T0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme8Q715T0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms