Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms