Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NinlQ6ZQ12 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
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