Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ino80Q6ZPV2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ino80Q6ZPV2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ino80Q6ZPV2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms