Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube2oQ6ZPJ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2oQ6ZPJ3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms